Коллекция предметов связана непосредственно с городом Петербургом, начиная со времени его основания. В этот раздел входят предметы, обнаруженные при проведении археологических раскопок в Петропавловской крепости и исторической части города, при осуществлении реставрационных работ в памятниках архитектуры, а также найденные как подъемный материал при земляных работах и предметы, поступившие из частных коллекций.
Начало этого раздела положили предметы из археологических раскопок на Стрелке Васильевского острова, проводившиеся основоположником археологии Санкт-Петербурга А.Д. Грачом в 1952 г.